CARYOPHYLLACEAE 石竹科
DIANTHUS 石竹屬
... Dianthus pygmaeus 玉山石竹↓
台灣特有種，向陽植物，生於海拔1300-3100米。全年開花，是本行程最醒目的一種顯花植物。
COMPOSITAE(ASTERACEAE) 菊科
ANAPHALIS 籟簫屬
... Anaphalis morrisonicola 玉山抱莖籟簫（白花香青）↓
生於海拔1500-3950米。玉山抱莖籟簫植株較尼泊爾籟簫高，葉片狹長。
... Anaphalis nepalensis 尼泊爾籟簫↓
生於海拔3200-3950米，是圈谷中相當注目的植物。
CIRSIUM 薊屬
... Cirsium arisanense 阿里山薊↓
生於海拔2600-3950米。台灣薊屬植物變種有十多種，此種在高山較為常見。與咬人貓一樣，葉片刺毛令人刺痛。
EUPATORIUM 澤蘭屬
... Eupatorium chinense var. tozanense 塔山澤蘭↓
中海拔變種植物，與田代氏澤蘭近似，主差異在本種不具攀緣性。
PICRIS 毛蓮菜屬
... Picris hieracioides subsp. morrisonensis 玉山毛蓮菜↓
生於中、高海拔的台灣特有亞種植物。
CRASSULACEAE 景天科
SEDUM 佛甲草屬
... Sedum morrisonense 玉山佛甲草↓
台灣特有植物，生於海拔2900-3900米。
DIPSACACEAE 續斷科
SCABIOSA 山蘿蔔屬
... Scabiosa lacerifolia 玉山山蘿蔔↓
台灣特有植物，生於海拔3300-3900米。
ERICACEAE 杜鵑花科
RHODODENDRON 杜鵑花屬
... Rhododendron hyperythrum 南湖杜鵑↓
台灣特有種，生於海拔1400-3700米。其葉與香港的華南杜鵑一樣，粗糙、褐色。
GENTIANACEAE 龍膽科
GENTIANA 龍膽屬
... Gentiana arisanensis 阿里山龍膽↓
台灣特有種，生於海拔2500-3700米。花瓣內斑點極為吸引。
... Gentiana scabrida var. punctulata 黑斑龍膽↓
台灣特有種，生於海拔2300-3500米。原變種為 G. scabrida var. scabrida 玉山龍膽，分別在其顏色較原變種鮮艷，斑點褐色至黑色。
GERANIACEAE 牻牛兒苗科
GERANIUM 老鸛草屬
... Geranium hayatanum 單花牻牛兒苗（早田氏香葉草）↓
台灣特有種，生於海拔2500-3700 米。其葉在秋冬轉為經色極為耀眼。
ONAGRACEAE 柳葉菜科
EPILOBIUM 柳葉菜屬
... Epilobium nankotaizanense 南湖柳葉菜↓
台灣特有種，冰河期孑遺植物。屬台灣五種最稀有植物之一。生於海拔3500-3700米。
OXALIDACEAE 酢漿草科
OXALIS 酢漿草屬
... Oxalis acetocella subsp. Griffithii var. formosana 台灣山酢漿草（高山酢漿草）↓
中高海拔植物。葉子微酸。此種為 Oxalis acetocella 之亞種變種，屬罕見的四名植物。
POLYGONACEAE 蓼科
POLYGONUM 蓼屬
... Polygonum cuspidatum 虎杖↓
生於海拔1800-3400米。其種子呈紫白色往往令人誤以為花。
PRIMULA CEAE 報春花科
PRIMULA 櫻草屬
... Primula miyabeana 玉山櫻草↓
台灣特有種，生於2500-3500米。貌似櫻花，故名櫻草。
RANUNCULACEAE 毛茛科
CLEMATIS 鐵線蓮屬
... Clematis lasiandra 小木通↓
中高海拔攀藤植物。此種雖名「木通」，但不屬木通科植物。
ROSACEAE 薔薇科
PHOTINIA 石楠屬
... Photinia niitakayamensis 玉山假沙梨↓
生於海拔1700-3100米。果子苦澀。
POTENTILLA 翻白草屬
... Potentilla matsumurae var. pilosa 高山翻白草↓
台灣特有變種植物，生於中、高海拔。翻白草屬在台灣有六種，惟一此種小葉三枚，不易混淆。
URTICACEAE 蕁麻科
URTICA 蕁麻屬
... Urtica thunbergiana 咬人貓↓
低、中海拔植物。葉片帶刺，有毒，誤中者劇痛。與台灣蕁麻 U. taiwaniana、蠍子草 Girardinia diversifolia 同為三種具高危險性植物。
UMBELLIFERAE (APIACEAE) 繖形科
ANGELICA 當歸屬
... Angelica morrisonicola var. nanhutashanensis 南湖當歸↓
台灣特有種，生於海拔3000-3500米。原變種為 A. morrisonicola var. morrisonicola 玉山當歸（亦為台灣特有種），由於南湖圈谷的群落葉兩面披毛，故處理成玉山當歸的變種。
CUPRESSACEAE 柏科
JUNIPERUS 圓柏屬
... Juniperus squamata var. morrisonicola 玉山圓柏↓
台灣特有種。高山常見喬木，形態獨特
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